（1）扫描模块
扫描系统模块主要由针孔光栏控制以及光学切片的厚度、分光镜按波长发生改变环境光线信息传播发展方向、选择具有一定影响波长范围的光进行分析检测的发射荧光分色器、光电倍增管检测器组成。荧光样品中的混合荧光技术进入扫描器，经过我们检测针孔光栏、分光镜和分色器选择后，被分成各单色荧光，分别在不同的荧光通道问题进行研究检测并形成自己相应的共焦图象，同时在计算机屏幕上可以充分显示出了几个方面并列的单色荧光图象及其合成图象。
（2）荧光显微镜系统
激光共聚焦显微镜的光路应选择大数值孔径平场消色差物镜，可以方便地插入无限大光学系统的光学元件中，不影响成像质量和测量精度，能够获得更高的荧光和成像清晰度。
激光共聚焦显微镜研究所用的荧光显微镜可以大体与常规使用荧光显微镜相同，但又有其特点：需有光路转换控制装置，即汞灯与激光技术转换，同时汞灯光线设计强度可调；需与扫描器连接，使激光能进入一个显微镜物镜照射样品，并使样品发射的荧光信号到达目标检测器。
（3）常用激光器
激光共聚焦显微镜可以使用的激光光源有单激光和多激光技术系统，常用的激光器主要包括通过以下三种不同类型：
半导体工业激光器：405nm（近紫外谱线）
氩离子激光器：457nm、477nm、488nm、514nm（蓝绿光）
氦氖激光: 543nm (绿色-氦氖绿色激光)633nm (红色-氦氖红色激光)
紫外线激光: 351nm，364nm (紫外线)
（4）辅助设备
风冷、水冷冷却控制系统及稳压电路电源。
光通过扫描仪中照明针的孔光列放大，在样品的焦平面上形成点光源。 这包括样品在焦平面上的每个点的完整共焦图像，称为光片。
